Die jüdische Siedlung entstand in Divišov vor dem Jahr 1685. Die Synagoge, in der sich das Museum befindet, wurde in der 1. Hälfte des 19. Jahrhunderts im spätklassizistischen Stil mit einer Apsis errichtet.
Die ursprüngliche Kirche fiel, genau wie auch die sonstigen historischen Denkmale, sofern diese aus noch älterer Zeit stammten, einem verheerenden Brand von 1742 zum Opfer, bei dem fast das ganze Städtchen samt Kirche abbrannte; vernichtet wurden auch Amts- und Kirchenbücher usw.