Das Museum in Netvořice wurde 1919 mit Unterstützung der Gemeinde und des Vereins der Ureinwohner von Netvořice und Umgebung als städtisches Museum gegründet. Ursprünglich war es im Haus Nr. 7 untergebracht, 1924 erwarb es ein separates Gebäude, das sich bis heute dort befindet. Das Museum besitzt eine bemerkenswerte Sammlung von Steingut aus Týnec sowie eine Sammlung angewandter Kunst und Gegenstände des Volksschaffens - Münzen, Medaillen, Plaketten und Orden.
Das Museum wurde vom Museumsverein für die Erhaltung der Denkmäler von Netvořice und Umgebung gegründet, dessen Gründungsversammlung am 1. November 1919 stattfand. Ende 1922 hatte der Museumsverein 126 Mitglieder. Die wichtigsten Förderer des Museums waren die Gemeinde Netvořice und die Prager „Gesellschaft der Eingeborenen von Netvořice und Umgebung“. Die Sammlungen basierten hauptsächlich auf Spenden der Mitglieder des Heimatvereins. Im Jahr 1924 wies der Gemeinderat dem Museum und seinen wachsenden Sammlungen ein Haus mit Garten im ehemaligen Gutshof zu. Dieses wurde 1931 erweitert und um ein zweites Stockwerk aufgestockt. Dadurch erhielt das Museumsgebäude seine heutige Form.
Bis zum Beginn des Zweiten Weltkriegs bemühten sich die Mitglieder des Museumsvereins um die Verbesserung und Ergänzung der Sammlungen, insbesondere der einzigartigen Sammlung von Erzeugnissen aus der stillgelegten Steingutmanufaktur in Týnec nad Sázavou. Diese Tätigkeit wurde durch die Besetzung und anschließende Zwangsräumung von Netvořice gewaltsam unterbrochen. Die Museumssammlungen wurden eilig nach Benešov transportiert. Nach dem Ende des Krieges, mit der Rückkehr der vertriebenen Netvořáker, nahm der Museumsverein seine Arbeit wieder auf. Dank ihm kehrte 1947 der größte Teil der Museumsexponate zurück. 1952, als der Verein seine Tätigkeit einstellte, wurde die Verwaltung des Museums der Gemeinde Netvořice übertragen.
In den 1990er Jahren begann man, das Museumsgebäude schrittweise zu rekonstruieren und die Sammlungen besser zu organisieren. Auch die Aktivitäten des Eingeborenenvereins wurden wieder aufgenommen und er wurde unter dem Namen „Eingeborenenverein und Freunde des Museums in Netvořice“ neu gegründet.