Il existait déjà une communauté juive à Divišov avant 1695. La synagogue dans laquelle se trouve actuellement le musée fut construite dans la première moitié du XIXe siècle, dans un style classiciste décadent avec une abside.
L’église d’origine, ainsi tous les patrimoines historiques, dans le cas-où elles étaient encore conservés de l’époque plus ancienne, ont été détruits en en 1742, quand presque tout cette petite ville a brulé y compris l’église et détruits ont été aussi des livres administratifs, registres d’état civil de la paroisse, et autres.